ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΕΝΟΣ NGS ΠΑΝΕΛ 1021 ΓΟΝΙΔΙΩΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗ HRD ΣΕ ΚΛΙΝΙΚΑ ΔΕΙΓΜΑΤΑ

Εισαγωγή Η μοριακή ανάλυση του όγκου μέσω αλληλούχισης επόμενης γενιάς (Next Generation Sequencing, NGS) παρέχει τη δυνατότητα ανίχνευσης γενετικών παραλλαγών που σχετίζονται με την ανταπόκριση σε στοχευμένες θεραπείες, καθώς και την αξιολόγηση γενωμικών ουλών που υποδηλώνουν ανεπάρκεια στο μονοπάτι του ομόλογου ανασυνδυασμού (HRD). Η ανεπάρκεια αυτή αποτελεί κρίσιμο βιοδείκτη για την πρόβλεψη της απόκρισης σε αναστολείς PARP. Σκοπός Στην παρούσα μελέτη, αξιολογήθηκε η αποδοτικότητα μιας NGS δοκιμής 1021 γονιδίων για την ανάλυση του HRD score, σε σύγκριση με επικυρωμένες μεθόδους, σε ιστούς καρκίνου των ωοθηκών.Μέθοδοι Συνολικά, αναλύθηκαν 43 δείγματα όγκου από 34 ασθενείς με γνωστό HRD score, βάσει των επικυρωμένων μεθοδολογιών Myriad και OncoScan. Η ανάλυση πραγματοποιήθηκε με τη χρήση μεθοδολογίας NGS, η οποία περιλάμβανε την αλληλούχιση 1021 γονιδίων (Gene+), καθώς και την αξιολόγηση της γενωμικής αστάθειας. Η γενωμική αστάθεια υπολογίστηκε μέσω τριών βασικών βιολογικών παραμέτρων: LOH (Loss of Heterozygosity), TAI (Telomeric Allelic Imbalance) και LST (Large-Scale Transitions). Τα κύρια κριτήρια αξιολόγησης περιλάμβαναν τη συμφωνία των τιμών HRD, την ανίχνευση BRCA1/2 παραλλαγών και την επαναληψιμότητα της μεθοδολογίας. Αποτελέσματα Το 1021+HRD πανελ παρουσιάζει υψηλή συμβατότητα με το εγκεκριμένο Myriad HRD test, με συνολικό ποσοστό συμφωνίας 97,1% (33/34). Μόνο μία απόκλιση εντοπίστηκε (HRD 43 με το 1021 πάνελ έναντι 35 με το Myriad HRD test), πιθανώς λόγω διαφορών κοντά στο όριο ανίχνευσης. H ευαισθησία στην ανίχνευση BRCA1/2 παραλλαγών ήταν 100%. Επιπλέον, η επαναληψιμότητα στην ανίχνευση του HRD score ήταν 100% σε 12 επαναλαμβανόμενα δείγματα. Υπήρξε σταθερότητα στις θετικές HRD τιμές ακόμα και σε όγκους με χαμηλό TCC (≥20%) με ποσοστό συμφωνίας 95,7% (22/23). Πίνακας 1 Συμφωνία μεταξύ της επικυρωμένης μεθόδου NGS HRDv και της μεθόδου 1021+HRD HRDv + HRDv - PPV NPV OPA r HRD+(1021) 24 1 96.00% 100% 97.06% 0.9295 HRD- (1021) 0 9 100% 97.06% p< .00001 Συμπεράσματα H νέα NGS μεθοδολογία έδειξε υψηλή συμφωνία με εγκεκριμένες μεθοδολογίες για την ανίχνευση HRD, ισχυρή αναγνώριση BRCA παραλλαγών και εξαιρετική επαναληψιμότητα. Αυτά τα ευρήματα υποστηρίζουν τη χρησιμότητά της στην κλινική πράξη για την καθοδήγηση των θεραπευτικών αποφάσεων με αναστολείς PARP.