ΑΝΑΛΥΣΗ ΕΚΦΡΑΣΗΣ ΜΙΚΡΩΝ ΜΗ-ΚΩΔΙΚΩΝ ΜΟΡΙΩΝ RNA (MICRORNA) ΣΤΟN ΧΗΜΕΙΟΑΝΘΕΚΤΙΚΟ ΜΗ-ΜΙΚΡΟΚΥΤΤΑΡΙΚΟ ΚΑΡΚΙΝΟ ΤΟΥ ΠΝΕΥΜΟΝΑ (ΜΜΚΠ)

Εισαγωγή: Οι μεταβολές στο μονοπάτι επιδιόρθωσης βλαβών του DNA (DDR) μπορούν να επηρεάσουν την αποτελεσματικότητα της χημειοθεραπείας με βάση την πλατίνα, οδηγώντας στην ανάπτυξη χημειοανθεκτικότητας. Τα microRNAs (miRNAs), βασικοί ρυθμιστές της DDR, έχουν προταθεί ως πιθανοί βιοδείκτες πρόβλεψης της ανταπόκρισης στην πλατίνα στον μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (ΜΜΚΠ). Σκοπός: Στόχος της μελέτης μας ήταν, μέσω βιοπληροφορικής ανάλυσης, να εντοπίσουμε miRNAs  που παρουσιάζουν διαφορική έκφραση σε ασθενείς που έλαβαν χημειοθεραπεία με βάση την πλατίνα και να αναλύσουμε την έκφρασή τους σε δείγματα καρκινικού και παρακείμενου υγιούς ιστού από ασθενείς με εξαιρέσιμο ΜΜΚΠ. Μέθοδοι: H μελέτη βασίστηκε σε δύο σύνολα δεδομένων μικροσυστοιχιών miRNA από τη βάση Gene Expression Omnibus (GEO) που περιλάμβαναν δείγματα ασθενών με ΜΜΚΠ (n=69) που έλαβαν θεραπεία με βάση την πλατίνα. Η ανάλυση διαφορικής έκφρασης μεταξύ ασθενών που ανταποκρίθηκαν (n=33) και όσων δεν ανταποκρίθηκαν (n=36) πραγματοποιήθηκε με το πακέτο Limma στο R. Επιπλέον, τα επίπεδα έκφρασης των miRNA αξιολογήθηκαν μέσω ποσοτικής PCR πραγματικού χρόνου (qRT-PCR) σε δείγματα ασθενών (n=20). Αποτελέσματα: Η ανάλυση Limma εντόπισε 112 miRNAs με διαφορική έκφραση, ενώ αναδείχθηκαν 24 miRNAs με σταθερά πρότυπα υπερέκφρασης ή υποέκφρασης βάση μετα-ανάλυσης με χρήση μοντέλου τυχαίων επιδράσεων. Η ανάλυση επιβίωσης Kaplan-Meier ανέδειξε 22 miRNAs με στατιστικά σημαντική προγνωστική αξία στον ΜΜΚΠ. Η λειτουργική ανάλυση συνέδεσε αυτά τα miRNAs με βασικά μονοπάτια DDR, συμπεριλαμβανομένων των p53, Hippo, PI3K και TGF-β. Παράλληλα, αναγνωρίστηκε μια υπογραφή 6-miRNAs (miR-26a, miR-29c, miR-34a, miR-30e-5p, miR-30e-3p, και miR-497) που παρουσίαζαν υποέκφραση σε ασθενείς που δεν ανταποκρίθηκαν στην θεραπεία και συμμετοχή σε τουλάχιστον τρία μονοπάτια DDR. Η συγκριτική ανάλυση έκφρασης σε δείγματα ασθενών με εξαιρέσιμο ΜΜΚΠ επιβεβαίωσε τη διαφοροποιημένη έκφρασή τους. Συμπεράσματα: Συνοπτικά, η μελέτη μας ανέδειξε μια υπογραφή 6-miRNAs, με πιθανή προβλεπτική αξία για την ανταπόκριση στην πλατίνα. Απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για την κλινική τους εφαρμογή.